Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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