Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Samd1D3YXK1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Samd1D3YXK1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Samd1D3YXK1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Samd1D3YXK1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Samd1D3YXK1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms