Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms