Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspp1B2RX88 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms