Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clrn2B2RVW2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clrn2B2RVW2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms