Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt4B2RU40 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms