Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NhsB1AV60 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms