Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prr29B1ARI9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prr29B1ARI9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prr29B1ARI9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr29B1ARI9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms