Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Atp8b5A3FIN4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Atp8b5A3FIN4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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