Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms