Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms