Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8nlA2ABX0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms