Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal2aA2A9G7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms