Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Prdm16A2A935 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Prdm16A2A935 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Prdm16A2A935 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm16A2A935 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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