Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrit3W8DXL4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms