Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms