Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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