Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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