Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer1Q9Z2Y3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer1Q9Z2Y3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer1Q9Z2Y3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer1Q9Z2Y3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer1Q9Z2Y3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms