Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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