Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms