Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms