Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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VarsQ9Z1Q9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms