Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms