Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms