Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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