Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Col4a3Q9QZS0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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