Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms