Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms