Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pias4Q9JM05 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pias4Q9JM05 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms