Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp1Q9JLK7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp1Q9JLK7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms