Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tgm1Q9JLF6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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