Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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CtsmQ9JL96 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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CtsmQ9JL96 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms