Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms