Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ybx3Q9JKB3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms