Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc17Q9ESX4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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