Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms