Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tomm20Q9DCC8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tomm20Q9DCC8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms