Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms