Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms