Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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