Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4bQ9D8B3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms