Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms