Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nop56Q9D6Z1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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