Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Borcs6Q9D6W8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms