Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms