Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc83Q9D4V3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc83Q9D4V3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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