Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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