Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms