Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D131 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D131 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D131 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms